Pendidikan Doktor Ilmu Pertanian dilaksanakan melalui jalur pendidikan terstruktur (jalur perkuliahan / by course) dan jalur penelitian (by research). Saat ini Program Studi S3 Ilmu Pertanian Fakultas Pertanian Universitas Andalas didukung oleh tenaga pengajar (dosen) berkualifikasi Doktor, baik dari dalam maupun luar negeri. Program ini juga menyelenggarakan dual degree dan student exchange dengan beberapa perguruan tinggi internasional. Disamping itu, Fakultas Pertanian Universitas Andalas juga mengembangkan program fast track dalam upaya mempersingkat waktu studi mahasiswa.
“Menjadi lembaga pendidikan S3 Ilmu Pertanian terbaik dan berperan dalam jejaringan kerjasama akademis secara nasional dan internasional dalam aspek pertanian wilayah tropis”
1. Mengembangkan pendidikan Ilmu-ilmu Pertanian secara terstruktur dengan kurikulum yang menitikberatkan kepada kebutuhan pengembangan pertanian masa depan yang penuh tantangan di daerah tropis. 2. Memfokuskan penelitian tentang masalah pertanian lahan marginal tropis untuk berbagai produk pertanian tropis serta pembangunan pertanian berkelanjutannya. 3. Mengupayakan alih teknologi dan pemberdayaan masyarakat pertanian dalam arti luas pada lahan marginal tropis untuk menghasilkan produk-produk pangan yang berkualitas.
Menghasilkan sumber daya manusia begelar Doktor yang memiliki moralitas akademis dan religious yang berdisiplin dan berintegritas tinggi terhadap ilmu pengetahuan terhadap kebenaran yang hakiki.
Meningkatkan kapasitas sivitas akademika dalam menghasilkan ilmu pengetahuan dan teknologi yang diakui baik ditingkat nasional maupun internasional.
Menghasilkan karya pengetahuan teknologi Pertanian yang selain bermanfaat bagi perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi itu sendiri, juga bermanfaat bagi kemaslahan umat manusia umumnya.
Program Doktor Ilmu Pertanian Universitas Andalas menggelar workshop penelitian dengan narasumber Dr. D.A. Ary Samsura (Associate Professor Radboud University Netherlands). Kegiatan ini diselenggarakan di ruangan seminar Program Doktor Ilmu Pertanian Fakultas Pertanian Universitas Andalas.
